Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRF8Q02556 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms