Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM3AP98173 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms