Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3F3AP84243 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms