Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NME5P56597 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NME5P56597 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NME5P56597 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NME5P56597 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms