Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms