Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PITPNBP48739 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms