Protein–RNA interactions for Protein: P41279

MAP3K8, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K8P41279 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP3K8P41279 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP3K8P41279 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms