Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5C1P36542 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5C1P36542 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms