Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ABCC1P33527 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCC1P33527 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms