Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLD1P28340 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLD1P28340 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLD1P28340 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms