Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA3P25788 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms