Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP5A1P25705 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms