Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5F1P24539 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5F1P24539 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms