Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LHCGRP22888 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHCGRP22888 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms