Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCMT1P22061 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PCMT1P22061 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms