Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD247P20963 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD247P20963 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD247P20963 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD247P20963 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms