Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAV1P15498 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VAV1P15498 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms