Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB1P14653 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms