Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI2P10070 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI2P10070 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GLI2P10070 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GLI2P10070 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GLI2P10070 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GLI2P10070 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GLI2P10070 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GLI2P10070 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GLI2P10070 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GLI2P10070 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GLI2P10070 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GLI2P10070 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI2P10070 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI2P10070 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI2P10070 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI2P10070 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI2P10070 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI2P10070 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GLI2P10070 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms