Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ86

DUX4L3, Double homeobox protein 4-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L3P0CJ86 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L3P0CJ86 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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