Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEFMP07197 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEFMP07197 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEFMP07197 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEFMP07197 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms