Protein–RNA interactions for Protein: O95628

CNOT4, CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4O95628 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNOT4O95628 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms