Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPLO60437 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPLO60437 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPLO60437 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPLO60437 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPLO60437 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPLO60437 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms