Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN34H7C241 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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