Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms