Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPA5E9PKD4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPIPA5E9PKD4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms