Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms