Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PAXBP1Q9Y5B6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PAXBP1Q9Y5B6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms