Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RAD54L2Q9Y4B4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms