Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms