Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMP3Q9Y3E7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms