Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms