Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP8A1Q9Y2Q0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms