Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSEQ9UL01 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms