Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EPHA6Q9UF33 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EPHA6Q9UF33 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms