Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
REREQ9P2R6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REREQ9P2R6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms