Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD4AQ9P2Q2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms