Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms