Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDIT4Q9NX09 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms