Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PACSIN1Q9BY11 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PACSIN1Q9BY11 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms