Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms