Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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