Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNDC11Q9BVV2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC11Q9BVV2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms