Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAF4Q9BUZ4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAF4Q9BUZ4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms