Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms