Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGIP1Q9BQI5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms