Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USB1Q9BQ65 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms