Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TREX2Q9BQ50 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TREX2Q9BQ50 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms