Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM71F1Q96KD3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms