Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EME1Q96AY2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms